Η αλλαγή του πλαισίου συνεργασίας που είχε μέχρι προ τινός με τον υπουργό οδήγησε σύμφωνα με πληροφορίες του Portnet τον Γ. Θεοτοκά στην υποβολή της παραίτησης του. Οι ίδιες πληροφορίες αναφέρουν ότι από τον Δεκέμβριο είχε διαπιστώσει την πρόθεση του νέου υπουργού Ναυτιλίας Π. Κουρουμπλή να περιορίσει το πλαίσιο των αρμοδιοτήτων του γενικού γραμματέα Ναυτιλιακής Πολιτικής κι ο ίδιος είχε από τότε θέσει την παραίτηση του στη διάθεση του υπουργού. Επειδή όμως ο χρόνος περνούσε και το πλαίσιο συνεργασίας που έθετε η πολτική ηγεσία του υπουργείου ουσιαστικά «περιόριζε» τις αρμοδιότητες του γενικού, ο Γιάννης Θεοτοκάς υπέβαλε την παραίτηση του. Ο ίδιος πλέον επιστρέφει στο Πανεπιστήμιο (είναι καθηγητής Ναυτιλιακών Σπουδών στο Πανεπιστήμιο Αιγαίου), ενώ στο υπουργείο αναζητούν τον αντικατάσταση του – που μπορεί να προκύψει κι από εσωτερική μετακίνηση...
